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《第三军医大学学报》创刊于1979年，国内外公开发行。主要报道医药领域的新理论、新经验、新技术和新方法。
《第三军医大学学报》栏目设有：专家论坛、基础医学、临床医学、军事医学、预防医学、高原医学、综述、科研简报、技术方法、经验交流和个案与短篇报道。
《第三军医大学学报》主要读者对象：为医药学领域的中高级科研、医疗人员和高等医药院校的师生。
《第三军医大学学报》曾获得第二、三届国家期刊奖百种重点期刊，是中国综合性医药卫生类核心期刊、中国科技论文统计源期刊、中国科学引文数据库统计源期刊。被国内所有数据库和文摘杂志以及美国《化学文摘》(CA)、俄罗斯《文摘杂志》(Pж)作为源期刊收录。是中国被引频次最高的500种科技期刊。
